Николай Цискаридзе родился в Тбилиси 31 декабря 1973 года. Мать Николая звали Ламара Николаевна. Она была физиком, работала на атомной электростанции в Обнинске, затем преподавала физику и математику в средней школе в Тбилиси. Его отец, Максим Николаевич, был музыкантом, играл на скрипке. Он не принимал никакого участия в воспитании сына, мальчик рос с отчимом, который также как и мать Николая был педагогом.Родителям приходилось много работать и на время их отсутствия Николай оставался с няней. Именно эта женщина, способствовала гармоничному развитию личности ребенка. Она любила классическую литературу, знакомила своего подопечного с произведениями Толстого и Шекспира. Мальчика водили в театр и на разные выставки.Чувствуя в себе артистические способности, с самого детства он читал стихи собиравшимся в их квартире гостям, писал картины, исполнял музыкальные произведения и представлял артистические импровизации, срывая громкие овации от друзей семьи. Огромное впечатление на маленького Николая оказал балет «Жизель». Именно после этой постановки ему страстно захотелось стать танцором. В 1984 году он окончил Тбилисскую общеобразовательную школу и поступил в Тбилисское хореографическое училище. По его словам, его мать была против того, чтобы он занимался балетом, однако её переубедили педагоги, которые отметили его способности.
Некоторое время спустя стало очевидно, что местное училище не может стать надлежащей платформой для такого выдающегося таланта. В 1987 году Николай принимает решение переехать в Москву, где он поступает в столичное академическое хореографическое училище. Его педагогом становится Петр Пестов.